При определении налоговой базы по налогу на профессиональный доход (НПД) учитывается доход, полученный от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав). Расходы при исчислении НПД не учитываются. Это относится и к агентскому вознаграждению.
Поэтому в мобильном приложении "Мой налог" самозанятый указывает доход без вычета агентского вознаграждения.
Письмо Минфина России от 02.12.2022 N 03-11-11/118018