По общему правилу цена контракта является твердой и определяется на весь срок его исполнения (ч.2 ст.34 Закона N 44-ФЗ). Закон N 44-ФЗ не предусматривает возможности уменьшать на сумму НДС цену контракта, заключенного с контрагентом на УСН.
ФНС напомнила, что указание в государственном контракте цены "с НДС" само по себе не обязывает продавца, применяющего УСН, выставить счет-фактуру. Но если он по своей инициативе выставит счет-фактуру, то обязан будет уплатить в бюджет сумму налога в соответствии с п.5 ст.173 НК РФ. Такой же подход содержится в Определении ВС РФ от 08.02.2021 N 305-ЭС20-18251.
Дополнительно рекомендуем Готовое решение: Как указать НДС в государственном или муниципальном контракте. К примеру, в контракте можно предусмотреть вариативную формулировку условия о цене контракта. Она используется в некоторых типовых контрактах.
Письмо ФНС России от 10.10.2023 N СД-4-3/12950@